在受到感染時，醫生很多時都會處方抗生素作治療。由於抗生素能同時殺死腸道的好菌及壞菌，漸漸地流傳了一個說法 -「服用抗生素時應停吃益生菌」。

其實這個流言並不完全是錯。的確，抗生素是好壞菌通殺，如果益生菌與抗生素「同時」或以「非常接近的時間」到達腸道，益生菌當然會受到影響。但其實只要相隔一段合理的時間服用，益生菌不但不受影響，更可減輕抗生素帶來的副作用。